革兰氏阳性菌细胞壁特殊组份细胞壁较厚,约20～80mm.肽聚糖含量丰富,有15～50层,每层厚度1nm,约占细胞壁干重的50～80%.此外尚有大量特殊组份磷壁酸(Teichoicacid).磷壁酸是由核糖醇(Ribitol)或甘油(Glyocerol)残基经由磷酸二键互相连接而成的多聚物.磷壁酸分壁磷壁酸(Wallteichoicacid)和膜磷壁酸(Membraneteichoicacid)两种,前者和细胞壁中肽聚糖的N-乙酰胞壁酸连结,膜磷壁酸又称脂磷壁酸(Lipteichoicacid)和细胞膜连结,另一端均游离于细胞壁外.磷壁酸抗原性很强,是革兰氏阳性菌的重要表面抗原；在调节离子通过粘肽层中起作用；也可能与某些酶的活性有关；某些细菌的磷壁酸,能粘附在人类细胞表面,其作用类似菌毛,可能与致病性有关.此外,某些革兰氏阳性菌细胞壁表面还有一些特殊的表面蛋白,如A蛋白等,都与致病有关. 　　革兰氏阴性菌细胞壁特殊组份细胞壁较薄,约10～15nm,有1～2层肽聚糖外,约占细胞壁干重的5～20%.结构比较复杂.尚有特殊组份外膜层位于细胞壁肽聚糖层的外侧,包括脂多糖、脂质双层、脂蛋白三部分. 　　脂蛋白（Lipoprotein）一端以蛋白质部分共价键连接于肽聚糖的四肽侧链上另一端以脂质部分经共价键连接于外膜的磷酸上.其功能是稳定外膜并将之固定于肽聚糖层. 　　脂质双层是革兰阴性菌细胞壁的主要结构,除了转运营养物质外,还有屏障作用,能阻止多种物质透过,抵抗许多化学药物的作用,所以革兰氏阴性菌对溶菌酶、青霉素等比革兰氏阳性具有较大的抵抗力.一些化学物质如乙二胺四乙酸（EDTA）与2%十二烷基硫酸钠（SDS）或45%酚水溶液可以将外膜除去,而留下坚韧的肽聚糖层.此外,外膜蛋白质还可作为某些噬菌体和性菌毛的受体. 　　脂多糖（Lipopolysacchride,LPS）由脂质双层向细胞外伸出,包括类脂A、核心多糖、特异性多糖三个组成部分,习惯上将脂多糖称为细菌内毒素. 　　①类脂A：为一种糖磷脂,是由焦磷酸键联结的氨基葡萄糖聚二糖链,其上结合有各种长链脂肪酸.它是脂多糖的毒性部分及主要成份.为革兰氏阴性菌的致病物质.无种属特异性,各种革兰氏阴性菌内毒性引起的毒性作用都大致相同. 　　②核心多糖：位于类脂A的外层,由已糖、瘐糖、2-酮基—3—脱氧辛酸（KDO）、磷酸乙醇胺等组成.经KDO与类质A共价联结.核心多糖具有属特异性,同一属细菌的核心多糖相同. 　　③特异性多糖：在脂多糖的最外层,是由数个至数十个低聚糖（3～5单糖）重复单位所构成的多糖链.革兰氏阴性菌的菌体抗原（O抗原）就是特异多糖.各种不同的革兰氏阴性菌的特异性多糖种类及排列顺序各不相同,从而决定了细菌抗的特异性. 　　革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的细胞壁结构显著不同,导致这两类细菌在染色性、抗原性、毒性、对某些药物的敏感性等方面的很大差异.